Мы отгрузили продукцию Покупателю автотранспортом. Перевозчик находится на УСН, поэтому выставил нам документы без НДС. Для возмещения транспортных расходов мы выставили Покупателю счет-фактуру на ту же сумму, включая НДС, т.к. находимся на общей системе налого-обложения. Покупатель отказывается принимать наши документы и требует предоставить ему документы так же без НДС.
Имеем ли мы право оформить от себя документы на транспортные услуги без НДС, если это отражено через счет 90 "Продажи"?
Если имеем, то какие документы должны быть оформлены?
Ваша проблема возникла из разного понимания Вами и покупателем сути Ваших договорных отношений.
Вы отражаете сумму компенсации транспортных расходов в составе выручки от реализации исходя из предположения, что это Вы оказываете транспортные услуги покупателю. Соответственно, Вы обязаны эту сумму обложить НДС.
Покупатель исходит из предположения, что Вы в части транспортных услуг являетесь посредником, в этом случае Вы перевыставляете покупателю отдельный счет-фактуру транспортной организации, т.е. без НДС. Соответственно, сумма компенсации не входит в состав выручки от реализации, она у Вас в учете проходит транзитом через счета расчетов.
Чтобы не было такого разночтения договора, нужно четко прописать в договоре позицию по транспортным услугам.