Решение Вашего вопроса содержится, по нашему мнению, в различных частях НК.

В Письме Минфина России от 23.01.2013 N 03-02-07/1-15 указано:

«В соответствии с п. 1 ст. 83 Налогового кодекса Российской Федерации (далее - Кодекс) организации, в состав которых входят обособленные подразделения, расположенные на территории Российской Федерации, подлежат постановке на учет в налоговых органах по месту нахождения каждого своего обособленного подразделения.

Местом нахождения обособленного подразделения организации признается место осуществления этой организацией деятельности через свое обособленное подразделение, определяемое адресом».

Согласно п. 4 ст. 83 Налогового кодекса постановка на учет по месту нахождения обособленных подразделений (за исключением филиала, представительства) производится налоговиками на основании сообщений, представляемых организацией. Направить такое сообщение компания должна в инспекцию по месту своего нахождения в течение одного месяца со дня создания структурной единицы.

В Письме Минфина РФ от 28.09.2011 N 03-11-06/3/105 указано:

«Пунктом 2 ст. 346.28 Кодекса установлено, что организации и индивидуальные предприниматели, осуществляющие виды предпринимательской деятельности, переведенные решениями представительных органов муниципальных районов, городских округов, законодательных (представительных) органов государственной власти городов федерального значения Москвы и Санкт-Петербурга на уплату единого налога на вмененный доход, обязаны встать на учет в налоговом органе по месту осуществления предпринимательской деятельности (за исключением видов предпринимательской деятельности, указанных в абз. 3 п. 2 указанной статьи).

…

При осуществлении налогоплательщиком одного и того же вида предпринимательской деятельности в нескольких отдельно расположенных местах разд. 2 декларации заполняется отдельно по каждому месту осуществления такого вида предпринимательской деятельности (каждому коду ОКАТО)».

Таким образом, по нашему мнению, Вы не обязаны ставить на учет каждый объект деятельности, переведенный на ЕНВД, находящийся на территории, обслуживаемой одной ИФНС, но по каждому объекту в декларации по ЕНВД представляете отдельный расчет (раздел 2 Декларации). Вместе с тем, Вы обязаны ставить на учет каждое обособленное подразделение и, соответственно, при закрытии этого подразделения снимать его с учета.

Приводим выдержки из комментария к Письму Минфина России от 12 октября 2012 г. N 03-02-07/1-250:

«Пунктом 2 ст. 11 Налогового кодекса предусмотрено, что обособленным признается любое территориально удаленное от организации подразделение, если по месту его нахождения оборудованы стационарные рабочие места. При этом под местом нахождения подобной структурной единицы понимается место ведения юрлицом деятельности через него. Под стационарным рабочим местом - место, созданное на срок более одного месяца, где работник должен находиться или куда ему необходимо прибыть в связи с его работой и которое прямо или косвенно находится под контролем работодателя (ст. 209 ТК). Исходя из этого, в частности, можно сделать вывод, что обособленное подразделение компании необходимо регистрировать по каждому месту выполнения работ вахтовым методом сроком более месяца. Собственно говоря, именно такой вывод напрашивается из комментируемого Письма от 12 октября 2012 г. N 03-02-07/1-250.

Таким образом, можно констатировать, что в том месте, где компанией вахтовым методом выполняются те или иные работы сроком более месяца, она должна встать на учет в местной ИФНС, а по окончании работ сообщить о закрытии подразделения.

В принципе, и всегда в ответ на запросы относительно возникновения обособленного подразделения, финансисты в комментируемом Письме порекомендовали налогоплательщику проконсультироваться непосредственно с налоговой инспекцией в порядке, предусмотренном п. 9 ст. 83 Налогового кодекса, а именно в случае возникновения затруднений с определением места постановки на учет.